2025年度，复旦张江实现收入约人民币6.86亿元，同比相比上一年度约7.09亿元有所下降，幅度约3.3%。全年净利润由上年的盈利转为亏损1.57亿元，归属于母公司股东的净亏损同幅度变化。管理层指出，一方面，核心光动力技术平台、抗体偶联药物（ADC）平台及相关医疗器械的研发和产业化持续进行，研发投入及销售费用均显著攀升，导致整体盈利承压。

根据五年财务摘要，截至2025年末，公司总资产为2.39亿元（千万元单位换算为人民币约23.91亿元），较2024年下降7.6%；负债总额为2.74亿元（人民币），同比降幅2.6%。股东权益降至21.17亿元（人民币），主要受年度净亏损及利润分配等因素影响。

报告显示，光动力治疗和光诊断、抗体偶联药物等产品仍是复旦张江的重要收入来源，在皮肤科及肿瘤治疗领域获得一定市场份额并保持双线研发与商业化推进。外部对创新疗法与精准医疗需求的增长，为新型药物在国内外市场带来机遇，但也对公司持续研发投入和市场开拓提出更高要求。公司声称将继续强化核心平台的研发深度，通过适应症拓展、多元化技术合作及国际化布局，寻求长期竞争优势。

在治理与合规方面，董事会下设审核、薪酬、提名及战略委员会，聚焦内控审查、薪酬机制制定、董事与高管任免及重大投资项目评估等职能。审核委员会在报告期内重点审阅财务报告与内控运行效果，薪酬与提名委员会分别统筹董事及高级管理层的薪酬方案和提名任命，战略委员会则为公司重大项目和中长期规划提供决策参考。上述措施旨在规范公司治理、强化内部管控，并有效管控研发与投资等潜在风险。